2010年4月7日－8日，受科技部委托，国家自然基金委员会组织专家在北京对空间天气学国家重点实验室进行了评估。实验室评估专家组由9位专家组成。
评估专家组认真听取了实验室主任王赤研究员的实验室工作报告，以及魏奉思院士、史建魁、冯学尚、王赤和徐寄遥研究员的代表性研究成果的报告，审阅了实验室的承担项目任务书、代表性成果及规章制度，实地考察了实验室并与实验室科研人员进行了座谈。 评估专家组充分肯定了实验室在2005-2009的工作成绩，认为空间天气学国家重点实验室围绕灾害性空间天气对人类活动影响的科学前沿和国家需求，通过牵头多项国家重大项目，积极开展空间科学探测、空间物理及空间天气的基础与应用基础研究，取得了国内外学术界认可的成绩，为我国空间物理学科发展做出了重要贡献。
实验室在此期间，首先提出“子午工程”的科学思想，联合全国有关部委十余个单位共同推进“子午工程”的立项，牵头完成了项目申请书、可研报告和初步设计报告；利用“双星计划”的探测数据，取得了一批创新性的研究成果，首次提出了新的亚暴触发的锋面理论，发现了向阳面赤道区行星际磁场北向重联、弓激波前太阳风中的离子空洞等一批新现象；将太阳大气、行星际和地球空间扰动作为一个因果链系统进行研究，在太阳风暴的行星际动力学过程、太阳风与磁层相互作用以及大气潮汐波特性研究与中高层大气建模等方面取得了新的进展，通过国际合作发表《自然》文章2篇，获得欧空局Cluster突出贡献奖、何梁何利奖、中国青年科技奖等多个奖项。
国家重点实验室评估会议每五年举行一次。
评估会议会场
专家组考察实验室